Hola s3r0, como tú también me fabriqué un terrario a 3 alturas, y al estar pegado a otro mueble me encontré con el mismo problema.

Pues bien, yo le coloqué en un lado ventilación en la parte de arriba. Y, la única solución que encontré, fué ponerle un listón de unos 7 u 8 cm en la parte frontal abajo, arriba del listón irían las guías y sobre ellas corren los cristales. En el listón hice los agujeros de ventilación.

Así, en la izquierda, está la rejilla en la parte alta. Y en la derecha, los agujeros ( rejilla estrecha o cualquier cosa que se te ocurra ) en la parte de abajo, para que el aire gire de abajo a arriba.

El ventilador es lo que menos gracia me hace, pues aunque genere una pequeña corriente, no sé, no son buenas para ellos.

Saludos.